במסמך שנשלח אל המועצה להשכלה גבוהה, נכתב שכיוון שצה"ל הוא הריבון ביהודה ושומרון, המוסד החינוכי היה צריך את חתימתו של מפקד הכוחות באזור כדי לשדרג את עצמו מבחינה אקדמית - אבל אישור כזה מעולם לא ניתן.

מנהלי המוסד טענו כי שינוי שמו ל-"מרכז אוניברסיטאי" הוא שלב ביניים, לקראת הפיכתו לאוניברסיטה - אך המדינה קבעה כי בחמש השנים הקרובות לא תקום אוניברסיטה חדשה בישראל, וכי התואר "מרכז אוניברסיטאי" אינו מוכר.

יושב-ראש הוועד הפועל של המרכז ושר האוצר לשעבר, יגאל כהן-אורגד, אומר כי על המדינה לקבוע את סיווגו של המוסד על-פי הרמה האקדמית שבו, ולא על-פי שיקולים אחרים, שבהם מתן אישור על-ידי מפקדים צבאיים.

עוד טוענים באוניברסיטה כי השם שונה לאחר שהתקיימה בדיקת ממשלה מקיפה בנושא בשנת 2005, ומשרד המשפטים אישור בעצמו, דרך רשם העמותות, את שינוי השם. "גם ראש הממשלה הנוכחי, אהוד אולמרט, שלח לנו איגרת ברכה בנושא", הם אומרים.

"הם מכללה טובה, אך לא אוניברסיטה"
לטענת שרת החינוך, יולי תמיר, השם מטעה את הסטודנטים, וגורם להם לחשוב שהם מגיעים לאוניברסיטה. "ביקשנו מהם להסיר את המילה 'אוניברסיטאי' מהתואר, ולציין שהם מכללה - ואפילו אחת טובה".

למרכז האוניברסיטאי אריאל לא הגיעה עד כה הודעה רשמית ממשרד המשפטים על הדרישה לשינוי השם, ובמועצה להשכלה גבוהה מעריכים כי בשבוע הבא יגיע למרכז מסמך חתום ע"י רשם העמותות. מהמועצה נמסר כי הם רואים "חשיבות עליונה" בכך שהנהלת המרכז תפעל על פי החלטת משרד המשפטים, ותשנה את שם המוסד למכללה.