לאחר שקוצץ ועבר שינויים רבים, פרק הבריאות בחוק ההסדרים כולל רפורמה מרכזית אחת, שעיקרה ריסון הרפואה הפרטית. החוק מגביל, לראשונה, את היקף הרכש של קופות החולים במסגרת הביטוחים המשלימים מבתי החולים הפרטיים, כך שהקופות לא יוכלו לרכוש מבתי החולים שירותי רפואה בהיקף גדול מסך הרכש כיום.

במשרד האוצר מצאו כי שיעור הרפואה הפרטית מכלל שירותי הרפואה בישראל עולה עם השנים, ולכן הודיע כי פיקוח באמצעות מספר מיטות וחדרי ניתוח אינו מספק, ומעתה יוגבלו גם ההכנסות של בתי החולים הפרטיים.

הסעיף מעורר כעס בקרב רופאים ומוסדות אשפוז פרטיים, והוא צפוי להיתקל במאבק קולני. בשבוע שעבר פנתה הנהלת אסותא במכתב לרופאים המנתחים בבית החולים והצהירה כי אם הצעת האוצר תעבור, "נידרש לווסת את משאבי בית החולים ולהקטין את פעילות הרופאים במסגרת קופת החולים. החולים עלולים להידרש לשלם באופן פרטי על השירות".

מנכ"ל שירותי בריאות כללית, אלי דפס, מברך על הצעד, אך גם מסתייג: "הגיע הזמן שתהיה בקרה על בתי חולים הפרטיים, שכן לשתי המערכות יש זכות קיום. למערכת הפרטית יש מקום, והיא חייבת לחיות לצד המערכת הציבורית. בשנים האחרונות קרה דבר לא תקין - המערכת הפרטית פורחת - והציבורית מידרדרת. הצעד שנוקט האוצר נכון, אך במקביל יש לחזק את המערכת הציבורית".

סעיף נוסף בחוק קובע כי רופאים המנתחים או מטפלים באופן פרטי במוסד פרטי לא יוכלו לקבל את הכסף ישירות מהחולה או מחברת הביטוח. תחת זאת, התשלום יעבור דרך בית החולים הפרטי בבחינת כלי לפיקוח על הפעולות המתבצעות בבתי החולים הפרטיים ולהגנה על המבוטח: "כיום ניתנים שירותים רפואיים בבתי חולים פרטיים במודל של השכרת חדר לרופא ותשלום ישיר של מקבל השירות לרופא", נכתב בדברי ההסבר. "מצב זה אינו מאפשר פיקוח של הרגולטור על אופי ההתקשרות בין הרופא למטופל, ופותח פתח לניצול המטופל".

סעיף נוסף שצפוי לפגוע בבתי החולים הממשלתיים ולסייע לקופות החולים, קובע כי משרד הבריאות לא יוכל לנהל משא ומתן מרוכז עם קופות החולים בשם כמה בתי חולים על מחירי האשפוז. לטענת האוצר, משא ומתן כזה נגוע בניגוד עניינים, שכן משרד הבריאות הוא גם הבעלים של בתי החולים וגם הרגולטור של הקופות. עוד טוען האוצר כי במצב הנוכחי יש משום ניצול כוחו המונופוליסטי של משרד הבריאות, המנהל 70% מהיקף הסכמי הרכש בין הקופות לבתי החולים.

עוד משנה החוק את אופן החישוב של מדד יוקר הבריאות, שעל פיו מתוקצבות קופות החולים, כך שחלקם של השכר בכלל ושל השכר במקצועות הבריאות יהיו דומיננטיים יותר במדד. לפי החישוב שנערך בקופות החולים, שינוי זה אמור להוסיף להן כ–50 מיליון שקל בשנה - חמישית מסך ההוצאות על אשפוז הנובעות מעליית שכר הרופאים והאחיות.